Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TMPOP42166 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL355306.2-203ENST00000635102 1025 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TMPOP42166 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
TMPOP42166 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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