Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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HOXD13P35453 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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HOXD13P35453 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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HOXD13P35453 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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HOXD13P35453 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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