Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF655-222ENST00000493277 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PSG11-203ENST00000403486 1163 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL138828.1-207ENST00000417643 734 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL441992.1-201ENST00000443631 544 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL161646.1-201ENST00000447860 1013 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC111000.1-201ENST00000514545 713 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms