Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms