Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 FBP2P1-202ENST00000424473 530 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL121908.1-201ENST00000443055 668 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 GRM8-206ENST00000444921 1251 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL451074.1-202ENST00000453762 989 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC109454.1-201ENST00000471205 498 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC006387.1-203ENST00000494849 342 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC084251.1-201ENST00000521867 382 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL664P-201ENST00000584239 305 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC244196.3-201ENST00000614171 374 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NCAPH-201ENST00000240423 2763 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ZNF611-203ENST00000540744 4417 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 UGT2B28-201ENST00000335568 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 IL18R1-201ENST00000233957 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PTAFR-202ENST00000373857 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MYO1A-203ENST00000442789 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RCAN1-205ENST00000443408 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 CPM-211ENST00000551568 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MUC1-206ENST00000368390 804 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MUC1-210ENST00000368398 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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TRIM35Q9UPQ4 AC013399.1-201ENST00000450311 418 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 MED28P8-201ENST00000454831 521 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PPIAP28-201ENST00000458378 485 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 GNPDA1-212ENST00000513454 980 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 OR1P1-201ENST00000571766 994 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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