Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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