Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 KALRN-211ENST00000460856 6509 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PRDM10-201ENST00000304538 5817 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SMAD9-203ENST00000399275 5389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MYO6-204ENST00000369985 8575 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 STARD5-201ENST00000302824 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LRRC37BP1-203ENST00000417404 4742 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SYNE1-206ENST00000367253 5189 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF250-201ENST00000292579 6364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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