Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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