Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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