Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
BRD3Q15059 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms