Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ITGA9Q13797 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms