Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
AP3B2Q13367 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms