Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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IFT88Q13099 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
IFT88Q13099 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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