Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTP4A2Q12974 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms