Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms