Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 CD40LG-201ENST00000370628 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 FBP2P1-202ENST00000424473 530 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC016559.1-201ENST00000511420 199 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 FRG2MP-201ENST00000613317 856 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 NRG3-206ENST00000545131 2713 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CTDSPL2Q05D32 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms