Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ZNF776-201ENST00000317178 5292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ERG-201ENST00000288319 4919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CASC15-203ENST00000605917 4461 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ZNF471-202ENST00000591537 5859 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 PAPPA2-202ENST00000367662 9691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ASPA-201ENST00000263080 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CENPFP49454 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 NUP210L-203ENST00000368559 5889 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 TRANK1-201ENST00000429976 10481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms