Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC087855.2-201ENST00000518217 537 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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