Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 HNRNPCP2-201ENST00000399515 881 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 CELF2-AS2-202ENST00000432370 1227 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ZNF208-202ENST00000597040 781 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC007923.2-201ENST00000584218 1591 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms