Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRCP08575 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL355306.2-203ENST00000635102 1025 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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