Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VAX2Q9UIW0 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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