Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MIS18AQ9NYP9 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 ACADSB-202ENST00000368869 1599 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 OR10D3-201ENST00000318666 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
MIS18AQ9NYP9 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms