Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 VSIG1-202ENST00000415430 3236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 TIAL1-205ENST00000436547 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 YWHABP1-201ENST00000445359 727 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 C1orf87-201ENST00000371201 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SMG9Q9H0W8 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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