Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CEP44Q9C0F1 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms