Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 PTPRT-205ENST00000373193 12681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SCN8A-203ENST00000545061 11433 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
LRRIQ1Q96JM4 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms