Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
GTF3C6Q969F1 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms