Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PPFIBP2-216ENST00000530181 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 ARID5B-202ENST00000309334 3141 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SIMC1-201ENST00000332772 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL391095.1-201ENST00000422519 2004 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PPP2R2B-211ENST00000508545 2042 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC009053.1-202ENST00000563377 2051 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 FSD1L-202ENST00000374710 7664 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LINC01182-202ENST00000510907 2228 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 ELAVL2-203ENST00000380117 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 ARMC3-204ENST00000409983 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 FAM47C-201ENST00000358047 3270 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RPL7A-201ENST00000315731 680 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 GIP-201ENST00000357424 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MIR595-201ENST00000384905 96 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SNORD86-201ENST00000391196 86 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RN7SKP119-201ENST00000410753 273 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LINC02088-201ENST00000428134 620 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 EFCAB14P1-201ENST00000442409 463 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC092634.4-203ENST00000451395 448 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL109809.3-201ENST00000456875 246 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RN7SL416P-201ENST00000494042 298 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC092133.1-201ENST00000565828 719 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC093826.2-201ENST00000579042 108 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 VDAC1P8-210ENST00000610068 1251 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 MIR7150-201ENST00000614393 94 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC012594.1-254ENST00000628002 438 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 EYA1-201ENST00000303824 3930 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 GLULP5-201ENST00000547831 1390 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 AC010200.1-201ENST00000547380 1454 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
C4orf17Q53FE4 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AC068512.1-201ENST00000584542 1811 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 LGSN-201ENST00000370657 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 AURKA-204ENST00000395907 1902 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 TTC33-205ENST00000636106 2252 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 KIF6-208ENST00000538893 2386 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
C4orf17Q53FE4 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms