Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RTL8BQ17RB0 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms