Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC044839.3-201ENST00000532068 860 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USF2Q15853 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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