Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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RAB39AQ14964 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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RAB39AQ14964 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
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RAB39AQ14964 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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