Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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COL4A6Q14031 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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COL4A6Q14031 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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COL4A6Q14031 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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COL4A6Q14031 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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COL4A6Q14031 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
COL4A6Q14031 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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