Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
LAMB3Q13751 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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