Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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CUL3Q13618 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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