Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ITGB3BPQ13352 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms