Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
DUSP4Q13115 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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