Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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