Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SECISBP2L-209ENST00000559471 7176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
BPTFQ12830 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms