Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
SREBF2Q12772 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms