Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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PGGT1BP53609 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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