Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPS10P2-201ENST00000430953 494 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC244102.1-201ENST00000437309 848 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 WDR82P1-201ENST00000439836 939 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P27-201ENST00000449509 551 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL365436.1-201ENST00000452587 495 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 Z82173.1-201ENST00000453924 484 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 GCSAM-202ENST00000460387 623 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC008638.2-201ENST00000503840 715 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 FLJ46284-203ENST00000521230 407 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC123788.1-201ENST00000526922 783 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC073913.2-201ENST00000541512 145 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4A1P4-201ENST00000550578 1213 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC021755.3-201ENST00000560376 864 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AF001548.1-201ENST00000577048 550 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC105243.1-202ENST00000583942 847 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RAB13-205ENST00000614713 1353 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB4-209ENST00000522336 1551 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF174-203ENST00000571936 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC096745.2-201ENST00000627783 1914 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4D-208ENST00000502484 2478 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PTER-203ENST00000423462 3212 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-47P-201ENST00000362966 163 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA73A-201ENST00000364938 206 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LGSN-201ENST00000370657 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 FAM107B-202ENST00000378458 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CDK1-203ENST00000395284 1913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL512604.2-201ENST00000426946 1314 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4A1P10-201ENST00000428832 1216 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL10-AS1-204ENST00000436598 513 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC002366.1-201ENST00000446186 1190 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC012501.1-201ENST00000454312 555 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TXNP3-201ENST00000454560 301 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL109809.3-201ENST00000456875 246 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.23-201ENST00000517218 151 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC025252.2-201ENST00000537470 502 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC140118.1-201ENST00000539209 532 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms