Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 AFF2-205ENST00000370460 13746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP34Q70CQ2 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 OR7A15P-201ENST00000449848 1009 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 MADD-202ENST00000342922 6005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 NRAP-203ENST00000369358 5534 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 FRY-202ENST00000380250 10688 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 FRY-209ENST00000642040 10697 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 NPR3-202ENST00000326958 6380 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 SCN5A-210ENST00000455624 7170 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 BACH2-201ENST00000257749 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 UTY-201ENST00000329134 4325 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 TENM2-203ENST00000518659 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP34Q70CQ2 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms