Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P24-201ENST00000433516 273 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01501-203ENST00000449990 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TMEM97P1-201ENST00000452969 451 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 COX5BP3-201ENST00000454627 367 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SPAG11A-206ENST00000454911 521 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC117382.1-201ENST00000468074 730 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC020636.1-201ENST00000469268 565 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC091180.2-203ENST00000507337 601 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ALG1L12P-201ENST00000515046 434 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GOT1L1-202ENST00000518826 497 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SNRPCP17-201ENST00000520330 205 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC091114.1-201ENST00000522815 630 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 KCTD21-AS1-202ENST00000523626 555 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP004607.8-201ENST00000526848 323 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RAN-211ENST00000541679 572 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MRPL2P1-201ENST00000546688 919 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC128707.1-202ENST00000548963 693 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC079598.4-201ENST00000549647 265 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DNM1P49-201ENST00000564895 474 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 H3F3B-204ENST00000586607 551 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC005392.2-201ENST00000595748 301 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MIR4435-2HG-217ENST00000604981 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CR769775.3-201ENST00000610388 219 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC025031.3-201ENST00000611566 368 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL391903.2-201ENST00000614532 247 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL590491.1-202ENST00000618038 394 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL157359.3-201ENST00000623771 217 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL669831.6-201ENST00000635557 837 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LIPM-201ENST00000404743 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PPARG-201ENST00000287820 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CTAGE12P-201ENST00000400348 2364 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LRP4-AS1-201ENST00000502049 1504 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC00426-207ENST00000447147 1589 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC124017.1-202ENST00000506950 1616 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SH2D4A-202ENST00000518040 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.8 ms