Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 CLCN3P1-201ENST00000423965 1017 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 TRAV6-201ENST00000390428 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.1 ms