Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CCDC96Q2M329 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms