Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL840P-201ENST00000606883 284 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 LINC01142-201ENST00000440404 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P4-201ENST00000359165 1405 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 FER-209ENST00000618353 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 LINC00460-203ENST00000444865 739 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL124P-201ENST00000498656 285 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 LINC02058-201ENST00000507491 707 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R1AP1-201ENST00000525622 425 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 LINC01572-203ENST00000563823 563 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC087623.4-201ENST00000606593 695 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.212-201ENST00000636778 248 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 TTC39B-206ENST00000507285 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms