Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 FAF2P1-201ENST00000429974 1298 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 LINC01431-203ENST00000452395 505 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 SEC22A-210ENST00000492595 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AC110760.2-202ENST00000507517 946 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 LINC00632-203ENST00000602535 723 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NREPQ16612 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NREPQ16612 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NREPQ16612 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NREPQ16612 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NREPQ16612 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
NREPQ16612 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NREPQ16612 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NREPQ16612 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
NREPQ16612 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 GYG1P2-201ENST00000426437 1006 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NREPQ16612 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms