Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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