Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RAB39AQ14964 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms