Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CUL4BQ13620 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
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