Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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SP140Q13342 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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SP140Q13342 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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SP140Q13342 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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